Vytvoření 3D musculoskeletálního modelu

Navržený typ práce: Bakalářská práce     Celkový stav inzerátu: Obsazené


Kontext: vyvinuli jsme software, který vezme OpenSim muskuloskeletální model a příslušné dostupné 3D modely svalů a úponových oblastí a následně dokáže simulovat deformaci těchto svalů v reakci na pohyb kostí. Takovéto simulace jsou vhodné pro posouzení zátěže kostí a lze je použít např. pro prevenci/predikci zlomenin, ve sportovní medicíně, ... V praxi ale pro konkrétního pacienta nemáme 3D modely, natož pak OpenSim muskuloskeletální model, ale pouze CT/MRI snímky (obrázky).

Cíle práce je implementace automatické pipeline, která na základě MRI snímků připraví model vhodný pro náš simulátor. Tato pipeline využije TotalSegmentator (https://github.com/wasserth/TotalSegmentator?tab=readme-ov-file), metodu hlubokého učení, pro segmentaci CT/MRI dat, po extrakci 3D struktur pak použije nástroj STAPLE pro vytvoření OpenSim modelu. Pipeline bude ověřena na datech LHDL a dále pak na dalších minimálně dvou dalších datasetech a výsledky následné simulace budou porovnány mezi sebou a s těmi, které jsou publikovány.




Pro akad. rok: 2025/2026

Vložil: Doc. Ing. Josef Kohout, Ph.D.

Email: besoft@ntis.zcu.cz

Vloženo: 14.5.2025 000 01:20:02

Zdroj: externí systém

Katedry

Zkratka katedryNázev katedryStavSchválilVedoucí práce
FAV/KIVKatedra informatiky a výpočetní technikySchválenoDoc. Ing. Josef Kohout, Ph.D.
besoft@ntis.zcu.cz
Doc. Ing. Josef Kohout, Ph.D.
besoft@ntis.zcu.cz